Villa Fabbricotti dankt zijn naam aan Giuseppe Fabbricotti die het in 1864 kocht. In de veertiende eeuw was het gebouw eigendom van de familie Buoninsegni, daarna kwam het in de zestiende eeuw in handen van Strozzi, die er een jachthuis van maakte, dat “Lo Strozzino” genoemd werd.

Na het kopen van de villa, gaf Fabbricotti aan Vincenzo Micheli de opdracht om het gebouw te restaureren en het te transformeren tot een luxe residence. Micheli wijdde zich tevens aan de restauratie van de tuin, waarschijnlijk op basis van een project van de architect Giuseppe Poggi, waaraan men ook het Piazzale Michelangelo en de florentijnse lanen dankt.

Nadat het in 1935 door de italiaanse staat werd gekocht en in het middelpunt stond van lange gerechtelijke procedures, is Villa Fabbricotti tegenwoordig eigendom van de Gemeente Florence.

In de villa verbleven talrijke illustere persoonlijkheden , waaronder Elisa Baciocchi, zus van Napoleon en de groothertogin van Toscane, en de koningin Vittoria.